Yayım Tarihi: 04.08.2007
Özet: Yıllar önce bir grup ninja, Mouryou adlı şeytanın gücünü kullanarak bütün dünyayı fethetmeye çalışmışlar ancak başarısız olmuşlardır. Mouryou'nun bedeni ve ruhu iki farklı tapınağa mühürlenmiştir. Ancak Yomi, Mouryou'yu tekrar dünyaya çağırır ve bedenine kavuşana kadar kendi bedenini onun hizmetine sunar. Çok geçmeden başlayan savaşta Tsunade, Naruto'ya Shinon adlı rahibeyi koruma görevi verir. Üstelik bu görevde Sakura ve Lee ile birlikte Neiji'nin himayesinde olacaktır. Önemsiz gibi görünen bu görev aslında bütün savaşın kilit noktasıdır. Çünkü sadece rahibeler mühürleme yapabilmektedir ve Shinon geriye kalan tek rahibedir. Mouryou kendi bedenine kavuşmadan mühürleme işlemi yapılmak zorundadır ancak bu hiçte kolay olmayacaktır.

Yayım Tarihi: 02.08.2008
Özet: İkinci Ninja Savaşı sırasında Konoha tarafından yok edilen Gökyüzü Ülkesi'nin hayatta kalan üyeleri uzun zaman sonra güçlerini arttırarak Konoha'ya saldırılar. O sırada orada bulunan gizemli doktor Shinou sayesinde birçok yaralı ölümden kurtulur. Ancak Shinou'nun öğrencisi Amaru'nun köyü tehlikededir. Bu yüzden Tsunade; Naruto'nun, Sasuke'nin ve Hitana'nın doktor ile Amaru'ya eşlik etmelerini ister. Köye vardıklarında köyün harabeye döndüğünü görürler. Bu sırada gerçekleşen saldırı sırasında Shinoui, Amaru'yu kurtarmak için önüne atlar ve vücuduna saplanan kunailer yüzünden can verir. Ancak kısa zaman sonra bunun bir oyun olduğu ortaya çıkar. Shinou gerçekte kimdir ve ne istemektedir?

Yayım Tarihi: 01.08.2009
Özet: Hiruko adında, diğer ninjaların çakrasını emmeye yönelik bir jutsu geliştirmeye çalışan eski bir Kanoha ninjası yıllar sonra tekrar ortaya çıkar. Artık Chimera Tekniğini iyice geliştirerek Kekkei Genkai emebilecek duruma gelmiştir ve şimdi Hatake Kakashi'nin Kekkei Gankai'sini de emerek üstün ninja olmak istemektedir. Köyünün olası bir savaşa girmemesi için tek çarenin kendini düşmana feda etmek olduğuna karar veren Kakashi, bu fikrini Tsunade'ye bildirir ve köyden ayrılır. Ancak Naruto, böyle bir şeye izin vermeye niyetli değildir. Ne pahasına olursa olsun Kakashi'yi ve köyü kurtarmaya kararlıdır.

Yayım Tarihi: 31.07.2010
Özet: Naruto, Sakura, Sai ve Yamato, Ryuumyaku'nun gücünü kullanarak bütün dünyaya hükmetmek isteyen Mukade'yi yenmek için Rouran şehrinin yıkıntılarına gider. Mukade burada, uzay-zamanda bir yarık açarak Naruto'yu geçmişin Rouran'ına götürür. Mukade, açtığı bu yarık sayesinde Naruto'nun gittiği zamanın 6 yıl öncesine gitmiş ve Rouran'da Bakan Anrokuzan kimliğine bürünmüştür. Anrokuzan, Ruumyaku'nun gücü ile istediği kukla ordusunu kurar ve bu ordunun yapımında Rouran halkını köle gibi çalıştırır. Naruto, Anrokuzan'ın emellerine engel olmaya çalışırken ona bu görevde geçmişin ninjaları Aburame Shibi, Akimichi Chouza ve henüz Dördüncü Hokage olmamış babası Namikaze Minato eşlik eder.

Yayım Tarihi: 30.07.2011
Özet: Raikage'ye suikast girişimi iddiasıyla Kan Hapishanesi olarak da bilinen Houzukijou'ya kapattılan naruto, hapishane müdürü Mui'nin Gök Hapsi tekniği ile güçlerini kaybeder. Aynı zamanda canına kastedilen naruto, masumiyetini kanıtlamaya çalışıtken, bir yandan da gerçekleri ortaya çıkaracaktır.

Yayım Tarihi: 28.07.2012
Özet: Naruto ve arkadaşları gizemli Maskeli Shinobi’nin yarattığı Genjutsu’da tuzağa düşerler. Bu yeni dünyada veya gerçeklikte, Naruto ve Sakura dışındaki herkesin kişiliği tamamen değişmiştir. Ayrıca, ölü karakterler de artık canlıdır ve rolleri tersine çevrilmiştir. Naruto ve Sakura bu Genjutsu’dan çıkmanın bir yolunu bulmak ve işleri normale döndürmek zorundadırlar.