Logan New York ta bulunduğu sırada (Daha bilinen ismiyle Wolverine) Mariko isimli bir Japon Kadına aşık olur. Ama bir süre sonra Mariko bir anda ortadan kaybolur. Logan Mariko yu aramak için Japonya ya gider. Marikonun babası, Yashida Shingen, Kuzuryuu isimli yakuza örgütünün patronudur. Logan Mariko yu Shingen nin köşkünde bulur ve Japonya ya zorla geri getirildiğini öğrenir. Shingenin amacı Mariko yu politikada etkili olan bir dostuyla evlendirip örgütü ile bu dostu arasındaki ittifakı güçlendirmektir. Logan Shingenin köşkünde korumalarla dövüşürken zehirli bir iğne ile vurulur, zehrin etkisiyle iyileşme yeteneği oldukça düşer ve yavaşlar. Böylelikle Shingenle girdiği ölüm kalım dövüşünde kazanma şansını yitirmiştir. Logan ölümün eşiğinden gizemli Yukio tarafından kurtarılır. Yukio nun yardımlarıyla kendisini toparlar ve Shingen i alaşağı etmek için birlikte çalışmaya başlarlar.